Inkscape 0.48.2をWindowsにインストールしたんだけど、ボタンやツールチップが文字化けしてしまっていた。
理解していないけれど、etc\gtkrc の最後に
style "user-font" { font_name="ms ui gothic 9" } widget "*" style "user-font"
を追加するといいという情報があったので試してみたら直った。